厉害!复旦博士生写了130行代码,2分钟搞定核糖结果统计
2024-10-12 软件
4月7日,据南京大学官微消息,自三月初以来,该学校重新启动先导碱基筛查工作,要求班级辅导员必须核对学生“健康云”碱基未完成预览,保证“不漏全都”。然而,这样的人工核对,费力又易错误。
为此,资讯科学与工程所学院复旦大学陈书香并能研发了一项小计算机系统,几分钟就能并能核对数百人的碱基未完成预览,进一步提高了核对效率和精度。
图源:复旦官微
说起计算机系统分析方法,陈书香认为并不复杂,他第一间隔时间记得了以前学到过的OCR (Optical Character Recognition,光学系统字符鉴别)技术。
陈书香解释说:“OCR可以把图像当中的文字鉴别出来,转换为脚注资讯,就不方便用来核对了。而且因为碱基预览是存储字体,鉴别率非常高,几乎可以够100%准确。”
他还记得了Python语言当中的正则表达式—可以搜索到字符串当中的特定来进行主旨。“使用正则表达式就可以把想要的资讯从OCR鉴别的脚注当中配对出来。最后,确认好每张预览里的姓名、检测间隔时间和是否已采样等资讯后,再把所有人的结果输出到Excel文件当中,不方便人工确认。”
最后,陈书香确定了“OCR文字鉴别+正则表达式配对”的计算机系统思路。3月15日晚,他花了一个多小时就写出了初始示例,一共130行。计算机系统一写好,陈书香就在自己班级的碱基预览信息上来进行检验,准确率果然很高,甚至检测出了之前人工核对没有发现的情况。
目前,计算机系统已在该所学院免费2周。800幅预览,本来要几个人核对一个多小时,直到现在只需等2分钟就拿到结果。
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